Le nombre de bactéries, virus et germes est très élevé chez les animaux qui, souvent, en deviennent des vecteurs. Un des aspects les plus problématiques est certainement la transmission de l’animal vers l’homme. Les bactéries, virus et germes sont en effet nombreux à entrer facilement en contact avec les personnes (adultes et enfants) par contact direct ou par contact avec du matériel contaminé par l’animal infecté (niches, couchettes, écuelles, écuries…). Un rôle essentiel dans la contamination est également recouvert par le terrain souillé d’excréments.
Un exemple de maladie transmissible est la Rage (virus aux effets graves et irréparables sur le système nerveux) ou la Bartonellose (due à un parasite hématique transmis à l’homme par la puce et le chat via morsure ou griffure). Mais il en existe plein d’autres qui viennent ainsi augmenter la liste des ennemis des animaux.